转座子整合稳定细胞株
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▏ 名字定义
转座因子（Transposable element，简称TE），又称“跳跃基因”，是指从基因组的一个位置移动到另一个位置的DNA序列。这类因子最早由遗传学家芭芭拉·麦克林托克于50多年前发现。起初，生物学家对麦克林托克的发现持怀疑态度。然而，在接下来的几十年里，人们逐渐发现，TE不仅会“跳跃”，而且几乎存在于所有生物体（包括原核生物和真核生物）中，而且通常数量巨大。例如，TE约占人类基因组的50%，占玉米基因组的90%。
▏ 转座子类型
根据转座机制，转座因子可分为两类：
1.I类转座因子（也称为逆转录转座子）
2.II类转座因子（也称为DNA转座子）。
图1：不同真核生物基因组中逆转录转座子和DNA转座子的相对数量。
该图显示了DNA转座子和逆转录转座子在各物种中占转座因子总数的百分比。（Sc：酿酒酵母；Sp：粟酒裂殖酵母；Hs：智人；Mm：小家鼠；Os：水稻；Ce：秀丽隐杆线虫；Dm：果蝇；Ag：冈比亚按蚊（疟蚊）；Aa：埃及伊蚊（黄热病蚊）；Eh：溶组织内阿米巴；Ei：入侵内阿米巴；Tv：阴道毛滴虫。）
I类转座因子（TE）：逆转录转座子
I类转座子也称为逆转录转座子。它们通过“复制粘贴Ctrl C+V”机制进行转座（图1）。它们首先将自身复制为RNA转录本，然后依靠逆转录酶逆转录回DNA，最终插入新的靶位。这与逆转录病毒（如HIV）的复制方式类似。
I类转座子不编码转座酶。I类TE被认为是具有复制性的，因为它们每次跳跃都会复制自身。这增加了TE的拷贝数量，同时也增加了宿主基因组的大小。
I类转座子有两种类型：具有长末端重复序列（LTR）的转座子和不具有长末端重复序列（非LTR转座子）。LTR逆转录转座子的结构和复制机制与逆转录病毒相似。它们包含两个基因： gag和pol。pol多聚蛋白编码LTR逆转录转座子转座所需的逆转录酶和整合酶。非LTR逆转录转座子包含两个开放阅读框（ORF），通常以poly(A)结尾。ORF2编码内切酶和逆转录酶活性。
图 1：逆转录转座子转座概述。逆转录转座子通过“复制粘贴Ctrl C+V”机制进行移动。
II类TE：DNA转座子
II类转座子也称为DNA转座子，因为它们在移动时不需要RNA中介。大多数II类转座子具有非复制性的“剪切粘贴Ctrl X+V”转座机制：它们首先从一个位置切除自身，然后插入到另一个位置（图2）。II类转座子的两端均有长末端重复序列（LTR）。
